Почти каждый седьмой житель Литвы (14%) считает, что в стране распространена религиозная нетерпимость. Об этом свидетельствуют данные исследования Eurobarometer. Несмотря на терпимость, декларируемую жителями Литвы, исследование, проведенное по заказу Института гражданского общества, показало, что число литовцев, не желающих жить в соседстве с мусульманами, за последние 5 лет увеличилось с 31% до 51%. Социальный психолог Кястутис Драгунявичюс убежден, что важную роль тут играют стереотипы. По мнению психологов, многое изменится, если литовцы будут чаще общаться с мусульманами. Например, целый ряд литовцев общается с русскими, православными, и в отношении этой религии они чувствуют себя гораздо спокойнее, чем в отношении ислама. Тем, что мусульмане не только в мире, но и в Литве порой ассоциируются с террористами, недоволен и муфтий мусульман-суннитов Литвы Ромас Якубаускас.